MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV19

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007505	CGG	2	6	184	189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045243
2	NC_007505	GTC	2	6	195	200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045243
3	NC_007505	GAT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045243
4	NC_007505	AAG	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045243
5	NC_007505	AGC	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045243
6	NC_007505	TGC	2	6	389	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045243
7	NC_007505	ACCA	2	8	452	459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007505	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007505	GCA	2	6	721	726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
10	NC_007505	GAC	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
11	NC_007505	TTC	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045244
12	NC_007505	TCG	2	6	797	802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045244
13	NC_007505	GCC	2	6	829	834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045244
14	NC_007505	AAC	2	6	847	852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045244
15	NC_007505	ACG	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045244
16	NC_007505	GGC	2	6	1015	1020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
17	NC_007505	CGG	2	6	1044	1049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
18	NC_007505	ATC	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
19	NC_007505	ATCA	2	8	1156	1163	50 %	25 %	0 %	25 %	78045244
20	NC_007505	TGG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
21	NC_007505	GGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
22	NC_007505	TGG	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
23	NC_007505	CGCA	2	8	1297	1304	25 %	0 %	25 %	50 %	78045244
24	NC_007505	CGG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
25	NC_007505	GAGCTG	2	12	1398	1409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78045244
26	NC_007505	GGC	2	6	1410	1415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
27	NC_007505	GT	3	6	1444	1449	0 %	50 %	50 %	0 %	78045244
28	NC_007505	CCG	3	9	1535	1543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045244
29	NC_007505	GGC	2	6	1668	1673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
30	NC_007505	AGCC	2	8	1692	1699	25 %	0 %	25 %	50 %	78045244
31	NC_007505	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
32	NC_007505	CAT	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
33	NC_007505	AAG	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045244
34	NC_007505	TCGC	2	8	1908	1915	0 %	25 %	25 %	50 %	78045244
35	NC_007505	GCG	3	9	1921	1929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
36	NC_007505	GCTG	2	8	2025	2032	0 %	25 %	50 %	25 %	78045244
37	NC_007505	T	6	6	2199	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	78045244
38	NC_007505	TGG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045244
39	NC_007505	CA	3	6	2393	2398	50 %	0 %	0 %	50 %	78045244
40	NC_007505	CAT	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
41	NC_007505	ATC	2	6	2629	2634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045244
42	NC_007505	ACA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045244
43	NC_007505	GCG	2	6	2723	2728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
44	NC_007505	AG	3	6	2737	2742	50 %	0 %	50 %	0 %	78045244
45	NC_007505	CCA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045244
46	NC_007505	CTC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045244
47	NC_007505	CGGG	2	8	2819	2826	0 %	0 %	75 %	25 %	78045244
48	NC_007505	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
49	NC_007505	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045244
50	NC_007505	CTTTT	2	10	3091	3100	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007505	TTG	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045245
52	NC_007505	GCC	2	6	3180	3185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045245
53	NC_007505	TGG	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045245
54	NC_007505	GGT	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045245
55	NC_007505	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045245
56	NC_007505	T	6	6	3373	3378	0 %	100 %	0 %	0 %	78045245
57	NC_007505	AG	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	78045245
58	NC_007505	TCC	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045245
59	NC_007505	TC	3	6	3495	3500	0 %	50 %	0 %	50 %	78045245
60	NC_007505	TGGT	2	8	3521	3528	0 %	50 %	50 %	0 %	78045245
61	NC_007505	CGG	2	6	3634	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045245
62	NC_007505	CCCGC	2	10	3734	3743	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_007505	TTGG	2	8	3751	3758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007505	CAT	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045246
65	NC_007505	ATG	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045246
66	NC_007505	GC	3	6	3852	3857	0 %	0 %	50 %	50 %	78045246
67	NC_007505	CAG	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045246
68	NC_007505	GCA	3	9	4001	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045246
69	NC_007505	GGT	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045246
70	NC_007505	AAG	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045246
71	NC_007505	GTG	3	9	4305	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007505	GCT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007505	GATC	2	8	4404	4411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007505	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007505	GCC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007505	ATAG	2	8	4587	4594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007505	ATCG	2	8	4616	4623	25 %	25 %	25 %	25 %	78045247
78	NC_007505	CCA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045247
79	NC_007505	GCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045247
80	NC_007505	GCC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045247
81	NC_007505	CGCA	2	8	4767	4774	25 %	0 %	25 %	50 %	78045247
82	NC_007505	GAC	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045247
83	NC_007505	TCA	3	9	4828	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045247
84	NC_007505	CGT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045247
85	NC_007505	AGTC	2	8	4853	4860	25 %	25 %	25 %	25 %	78045247
86	NC_007505	CTT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045247
87	NC_007505	CG	3	6	5038	5043	0 %	0 %	50 %	50 %	78045248
88	NC_007505	TCT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045248
89	NC_007505	CGG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045248
90	NC_007505	TG	3	6	5101	5106	0 %	50 %	50 %	0 %	78045248
91	NC_007505	GGCA	2	8	5161	5168	25 %	0 %	50 %	25 %	78045248
92	NC_007505	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045248
93	NC_007505	GCC	3	9	5347	5355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045249
94	NC_007505	GCT	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045249
95	NC_007505	GTC	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045249
96	NC_007505	AT	3	6	5592	5597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007505	ATTG	2	8	5619	5626	25 %	50 %	25 %	0 %	78045250
98	NC_007505	TGC	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
99	NC_007505	TCGT	2	8	5718	5725	0 %	50 %	25 %	25 %	78045250
100	NC_007505	CCG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045250
101	NC_007505	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
102	NC_007505	CGC	2	6	5919	5924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045250
103	NC_007505	TCG	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045250
104	NC_007505	CAA	2	6	6038	6043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045250
105	NC_007505	TTCGA	2	10	6106	6115	20 %	40 %	20 %	20 %	78045250
106	NC_007505	AGC	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045250
107	NC_007505	GAC	3	9	6179	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045250
108	NC_007505	GC	3	6	6199	6204	0 %	0 %	50 %	50 %	78045250
109	NC_007505	CGG	2	6	6219	6224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
110	NC_007505	TC	3	6	6284	6289	0 %	50 %	0 %	50 %	78045250
111	NC_007505	GAG	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045250
112	NC_007505	GC	3	6	6378	6383	0 %	0 %	50 %	50 %	78045250
113	NC_007505	GGA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045250
114	NC_007505	CAT	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045250
115	NC_007505	GCG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
116	NC_007505	CT	3	6	6650	6655	0 %	50 %	0 %	50 %	78045250
117	NC_007505	CGG	2	6	6868	6873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045250
118	NC_007505	TCA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045250
119	NC_007505	ACC	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045250
120	NC_007505	AGT	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045250
121	NC_007505	CCGA	3	12	7133	7144	25 %	0 %	25 %	50 %	78045250
122	NC_007505	CA	3	6	7213	7218	50 %	0 %	0 %	50 %	78045250
123	NC_007505	CAC	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007505	AG	3	6	7317	7322	50 %	0 %	50 %	0 %	78045251
125	NC_007505	A	6	6	7333	7338	100 %	0 %	0 %	0 %	78045251
126	NC_007505	CGC	2	6	7347	7352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045251
127	NC_007505	AG	3	6	7398	7403	50 %	0 %	50 %	0 %	78045251
128	NC_007505	CAG	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045252
129	NC_007505	TGC	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045252
130	NC_007505	CGG	2	6	7776	7781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045252
131	NC_007505	CG	3	6	7788	7793	0 %	0 %	50 %	50 %	78045252
132	NC_007505	CAG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045252
133	NC_007505	TAGA	2	8	7876	7883	50 %	25 %	25 %	0 %	78045252
134	NC_007505	GCT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045252
135	NC_007505	ACC	2	6	7965	7970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007505	GGA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007505	TGCCC	2	10	8034	8043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_007505	ACGG	2	8	8086	8093	25 %	0 %	50 %	25 %	78045253
139	NC_007505	GCC	2	6	8128	8133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
140	NC_007505	CGC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
141	NC_007505	TCCA	2	8	8193	8200	25 %	25 %	0 %	50 %	78045253
142	NC_007505	AGT	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045253
143	NC_007505	A	6	6	8247	8252	100 %	0 %	0 %	0 %	78045253
144	NC_007505	CGC	2	6	8273	8278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
145	NC_007505	ACTG	2	8	8351	8358	25 %	25 %	25 %	25 %	78045253
146	NC_007505	CAA	2	6	8468	8473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045253
147	NC_007505	CTG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045253
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149	NC_007505	GCC	2	6	8680	8685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045253
150	NC_007505	CTC	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045253
151	NC_007505	GTA	2	6	8856	8861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045253
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161	NC_007505	CTT	2	6	9256	9261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_007505	CT	4	8	9350	9357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_007505	GGCG	2	8	9628	9635	0 %	0 %	75 %	25 %	78045255
164	NC_007505	GGATCA	2	12	9643	9654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78045255
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166	NC_007505	TTC	2	6	9699	9704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045255
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169	NC_007505	GGAC	2	8	10140	10147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_007505	GAA	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007505	ATC	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007505	G	6	6	10283	10288	0 %	0 %	100 %	0 %	78045256
173	NC_007505	CGA	2	6	10297	10302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045256
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175	NC_007505	CGCAA	2	10	10418	10427	40 %	0 %	20 %	40 %	78045256
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199	NC_007505	CGC	2	6	11385	11390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045257
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269	NC_007505	TGT	2	6	14542	14547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045258
270	NC_007505	ATC	2	6	14550	14555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045258
271	NC_007505	TCA	2	6	14619	14624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045258
272	NC_007505	TGC	2	6	14657	14662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045258
273	NC_007505	GAT	2	6	14678	14683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045258
274	NC_007505	CGA	2	6	14699	14704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045258
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277	NC_007505	GC	3	6	14861	14866	0 %	0 %	50 %	50 %	78045259
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282	NC_007505	T	9	9	15045	15053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007505	CAA	2	6	15123	15128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_007505	ATT	2	6	15167	15172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007505	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	78045260
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287	NC_007505	GGC	2	6	15271	15276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045260
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310	NC_007505	T	6	6	16316	16321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_007505	ACG	2	6	16362	16367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_007505	AGG	2	6	16369	16374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
313	NC_007505	AGT	3	9	16440	16448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_007505	AGAGG	2	10	16466	16475	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
315	NC_007505	TAGA	2	8	16511	16518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
316	NC_007505	ATC	2	6	16522	16527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_007505	T	7	7	16539	16545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_007505	GAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
319	NC_007505	CAA	2	6	16667	16672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
320	NC_007505	CCG	2	6	16727	16732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
321	NC_007505	GCC	2	6	16741	16746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
322	NC_007505	GGC	2	6	16749	16754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_007505	CGCC	2	8	16838	16845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
324	NC_007505	GCC	2	6	16924	16929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
325	NC_007505	GGC	2	6	16933	16938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
326	NC_007505	GCCC	2	8	16978	16985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
327	NC_007505	TGG	2	6	17042	17047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_007505	GTT	2	6	17316	17321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
332	NC_007505	TGAGT	2	10	17329	17338	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
333	NC_007505	AAG	2	6	17420	17425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045261
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343	NC_007505	AG	3	6	18028	18033	50 %	0 %	50 %	0 %	78045262
344	NC_007505	CA	3	6	18068	18073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
345	NC_007505	A	6	6	18073	18078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_007505	T	7	7	18093	18099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_007505	TGGCGG	2	12	18216	18227	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045263
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368	NC_007505	GCC	2	6	18985	18990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045264
369	NC_007505	CATGA	2	10	18994	19003	40 %	20 %	20 %	20 %	78045264
370	NC_007505	GTT	2	6	19014	19019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045264
371	NC_007505	GAA	2	6	19044	19049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045264
372	NC_007505	GCC	2	6	19105	19110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.